(Не) вообичаениот осомничен за романот коронавирус со потекло од лилјак

A неодамнешната студија идентификува на нов коронавирус одговорен за епидемијата на пневмонија во провинцијата Хубеи во Кина- вирусот со потекло од лилјак е поврзан со други познати патогени коронавируси

на 2019 нов коронавирус (CoV) предизвикува фатална пневмонија која однесе над 1300 животи, со повеќе од 52000 потврдени случаи на инфекција од 13 февруари 2020 година, сè во период од нешто повеќе од еден месец. Но, што е овој вирус? Дали е тоа воопшто нов вирус? Од каде потекнува? Научниците од врвните истражувачки институти во Кина се здружија за да одговорат на овие прашања и оваа пионерска студија е објавена во Кинески медицински журнал.

https://www.youtube.com/watch?v=jFKWluuMdgs

На почетокот на декември, неколку луѓе во градот Вухан во провинцијата Хубеи во Кина почнаа да се разболуваат откако отидоа на локален пазар на морска храна. Тие доживеале симптоми како кашлица, треска и отежнато дишење, па дури и компликации поврзани со синдромот на акутен респираторен дистрес (ARDS). Непосредната дијагноза беше пневмонија, но точната причина не беше објаснета. Што ја предизвика оваа нова епидемија? Дали е тоа тежок акутен респираторен синдром (САРС) -CoV? Дали е тоа респираторен синдром на Блискиот исток (МЕРС) -CoV? Како што се испостави, научниците презеле студија за идентификување на овој вирус во декември, откако ги анализирале првите неколку случаи. Оваа студија сега е објавена во Кинески медицински журнал и идентитетот на вирусот е утврден - тој е комплетно нов вирус, тесно поврзан со лилјакот САРС-како CoV. Д-р ianианвеи Ванг (Кинеска академија за медицински науки, Институт за биологија на патогени), водечки истражувач на студијата, изјавува „Нашиот труд го утврди идентитетот на CoV од потекло од лилјак, кој беше непознат до сега."

Во оваа студија, научници од реномирани истражувачки институти во Кина, како што се Кинеската академија за медицински науки, Институтот за биологија на патогени, Болница за пријателство Кина-Јапонија и Медицинскиот колеџ во Пекинг, заеднички го откриле и идентификувале новиот CoV - главниот виновник за избувнувањето на Вухан - со секвенционирање на следната генерација (NGS). Тие се фокусираа на пет пациенти примени во болницата Jinин Јин-тан во Вухан, од кои повеќето беа работници на пазарот за морска храна Хуанан во Вухан. Овие пациенти имале висока температура, кашлица и други симптоми и првично им било дијагностицирано пневмонија, но од непозната причина. Состојбата на некои пациенти брзо се влоши во ARDS; еден дури починал. Д-р Ванг вели: „Рентгенските снимки на градите кај пациентите покажаа нејасна заматеност и консолидации, кои се типични за пневмонија. Сепак, сакавме да откриеме што е причина за пневмонија, а нашите последователни експерименти ја открија точната причина- нов CoV што не беше познат порано."

За студијата, научниците користеле примероци на течност од бронхоалвеоларна лаважа (БАЛ) земени од пациентите (БАЛ е постапка во која стерилната течност се пренесува во белите дробови преку бронхоскоп, а потоа се собира за анализа).

Прво, научниците се обидоа да го идентификуваат вирусот со секвенционирање на геномот, користејќи технологија NGS. NGS е префериран метод за скрининг за идентификување на непознати патогени, бидејќи брзо ги открива и исклучува сите познати патогени микроорганизми во примерокот. Врз основа на секвенционирање на ДНК / РНК од примероците на течности БАЛ, научниците откриле дека повеќето од читањата на вирусите припаѓаат на семејството CoV. Научниците потоа ги собраа различните „читања“ што припаѓаа на CoV и конструираа цела геномска низа за новиот вирус; овие низи беа 99.8-99.9% слични кај сите примероци на пациенти, потврдувајќи дека овој вирус е обичен патоген кај сите пациенти. Понатаму, користејќи анализа на хомологија, каде што геномната секвенца се споредува со другите познати секвенци на геноми (со претходно поставен праг од 90% за да се смета за „нова“ секвенца), тие потврдија дека геномната секвенца на овој нов вирус е 79.0% слично на SARS-CoV, околу 51.8% слично на MERS-CoV и околу 87.6-87.7% слично на другите CoV налик на SARS од кинески лилјаци за потковици (наречени ZC45 и ZXC21). Филогенетската анализа покажа дека низите на петте CoV добиени соеви беа најблиску до оние на соевите добиени од лилјак, но формираа одделни еволутивни гранки. Овие откритија јасно сугерираат дека вирусот потекнува од лилјаци. Д-р Ванг вели: „Бидејќи сличностите на генот на вирусна репликаза со сите други познати „слични“ вируси се уште се помалку од 90%, а исто така земајќи ги предвид резултатите од филогенетската анализа, сметаме дека ова е навистина нов, претходно непознат CoV. Овој нов вирус е привремено наречен 2019 година-ncov."

На крај, научниците се преселија на „изолирање“ на вирусот од примероците на течности БАЛ со проверка дали примероците на течности покажале цитопатски ефект врз клеточните линии во лабораторијата. Клетките изложени на примероците на течност биле забележани под електронски микроскоп, а научниците откриле карактеристични структури слични на CoV. Тие исто така користеле имунофлуоресценција - техника која користи специфични антитела обележани со флуоресцентни бои. За ова, тие користеа серум од пациенти кои се опоравуваа (кои содржеа антитела), кои реагираа со вирусните честички во клетките; ова потврди дека овој вирус навистина е причина за инфекцијата.

Оваа студија им го отвора патот на идните студии за подобро разбирање на вирусот и неговите извори, особено со оглед на неговото брзо ширење, неговата способност да предизвика фатален ARDS и паниката предизвикана од епидемијата. Иако 4 од 5 пациенти од кои е идентификуван овој вирус се од пазар на морска храна во Вухан, точното потекло на инфекцијата не е познато. CoV можеше да се пренесе на луѓето преку „среден“ носач, како што е случајот со SARS-CoV (месо од дланка) или MERS-CoV (камила). Д-р Ванг заклучува, „Сите човечки CoV се зоонозни и неколку човечки CoV потекнуваат од лилјаци, вклучително и SARS- и MERS-CoV. Нашата студија јасно ја покажува итната потреба за редовно следење на преносот на CoV од потекло од лилјак на луѓето. Појавата на овој вирус е огромна закана за јавното здравје и затоа е од клучно значење да се разбере изворот на овој вирус и да се одлучат за следните чекори пред да бидеме сведоци на поголема епидемија".